Клуб основан в 1961 году (первый официальный матч - 2 мая в Саранске против местного «Строителя»). В чемпионатах страны выступал под названиями «Геолог» (1961–1963, 1983–1991), «Прибой» (1964), «Нефтяник» (1965–1977), «Строитель» (1978, 1979), «Факел» (1980–1982), «Динамо-Газовик» (1992–1996). С 1997 года — «Тюмень» (в 2003 года тюменская команда называлась «СДЮШОР-Сибнефтепровод»).
Чемпион РСФСР (1985). Обладатель Кубка РСФСР (1984). Победитель турнира первой лиги первенства России (1993, 1996). Победитель зональных турниров второй лиги первенств СССР (1984–1986) и России (2013/14, 2022/23).
По итогам сезона 2013/14 «Тюмень» одержала победу в зональном турнире второго дивизиона и пополнила ряды первого дивизиона — ФНЛ, который вновь покинула по итогам сезона 2018/19.
В сезоне 2020/21 «Тюмень» была близка к возвращению в ФНЛ, финишировав второй. В следующем первенстве команда заняла третье место в ФНЛ-2. В сезоне 2022/23 тюменцы за два тура до финиша обеспечили себе первое место во второй лиге. В сезоне 2023/2024 команда 9 место в Мелбет Первой Лиге.
Главный тренер — Игорь Меньшиков
На данный момент ФК «Тюмень» занимает 18 место в турнирной таблице, имея в активе 6 очков (разница мячей -15).